运行&完成了不是

不是2023

不是2023是一个GPU的并行实时数据库搜索平台提供计算能力和实时数据库的搜索结果为自下而上的蛋白质组学。

直接结果!

实时搜索结果=效率

突出了

不是是效率和储蓄

实时搜索结果通知您当前的仪器和样品状态

分析时间
数据库搜索需要时间,消除与搜索结果毋庸置疑这一步一旦收购完成。
仪器的时间
确保分秒必争,不是你可以确信你的乐器时间是花在最有意义的方式。
珍贵的样本
保存这些珍贵的样本!无论是单个细胞,临床、SILAC或丰富铝;不是的智慧会确保它们不会浪费。
成本
仪器,试剂和样品制备是昂贵的。不是和运行&做会省钱,因为你保证产生有意义的数据。

Eigenschaften

不是2023

4 d-proteomics™和智能采集的实时搜索结果

打破瓶颈分析的数据集成实时数据库搜索和智能采集不提供的

普遍可用的

4 d-proteomics™

  • CCS-enabled数据丰富,即便如此实时数据库搜索功能是一个现实与不包括与磷酸化等多功能天车

大规模并行处理与GPU的力量

  • 不是显卡驱动,在成千上万的CUDA核心提供了巨大的计算能力

不是数据回顾

  • 视图的错综复杂的细节你的高水平实验的数据信息到一个特定的碎片离子谱综合观众的兴趣与信心上的不是盒子
智慧
  • 不是很聪明,一个用户定义的资格蛋白质或多肽的样本采集决定样本队列的进程,这检查适用性,保存珍贵的样本,昂贵的耗材和仪器

Vorteile

不是2023

受益于时间和节约成本

  • 不再担心注入那些珍贵的样本。
  • 没有仪器浪费时间的更令人担忧。
  • 不再担心那些昂贵的试剂和样品准备样品,只有注入一个贫穷的执行系统。
  • 不再等待质检运行来确定系统适用性。
  • 在方法开发不再等待搜索结果。

Anwendungen

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TIMScore™——机器学习和CCS开发更好的罗斯福

TIMScore提供了最大数量的PSM,肽和蛋白质识别真4 d-proteomics通过使CCS维度。

不是搜索算法运行正常,结合CCS预测和测量值的比较和计算前5的TIMScore肽为每个光谱候选人。

TIMScore好处是意识到在peptide-validation和错误发现率(罗斯福)估计的步骤。在非CCS-enabled算法,只能利用二维估计罗斯福速率,因此区分线适合1%的误差(面板)区分正向和反向肽的候选人。TIMScore,和额外的CCS维度,peptide-candidates可以在三维矢量化(面板B)允许歧视波状外形的飞机用于实现相同的1%的误差。

应用歧视飞机提供更高的准确度和精密度,帮助验证标准两个维度得分psm以前不佳。



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dia-PASEF工作流精简与蒂姆斯DIA-NN不是

不是2023能够处理dia-PASEF工作流使用一个定制版本的流行DIA-NN由神经网络(DIA)软件从Lilley Rasler和Demichev实验室。蒂姆斯DIA-NN使可靠的、健壮的、定量准确的大规模的实验。不是利用相同的流dia-PASEF工作流机制,实时流媒体和女士DIA帧从收购电脑不是盒子。这些dia-PASEF数据处理和存储的不是盒子。结束的时候触发采集光谱库搜索,结果记录下来。TIMScore动力DDA搜索结果可以很容易地利用建立光谱库或光谱库可以从其他受欢迎的进口工具。在项目结束的用户可以触发match-between-runs分析查看项目之间的定量资料。这将提供给用户一个集成环境PASEF和dia-PASEF数据分析。

轴数和轴总K562肽加载在毫微克的列。梯度长度是35分钟,支持每天30个样本与所有实验进行timsTOF专业2。

“我们正在进行的合作与力量裁缝DIA-NN流线型

dia-PASEF数据处理工具CCS重点都是真的

奖励。它简化和加速识别和量化

成千上万的蛋白质甚至很短的梯度。我们很高兴

在我们的密切合作与力量,vendor-integrated版本

DIA-NN叫做蒂姆DIA-NN现在变成不是生物信息学的一部分

平台。”

Markus Ralser博士教授,爱因斯坦查利特的生物化学教授,德国柏林

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成熟的数据库搜索不到5 ms

燃烧的搜索速度和搜索结果毋庸置疑。

)蛋白质ID复制银两的人类细胞溶解产物使用不是实时运行结果和以MaxQuant为基准

B)肽ID复制DDA运行的人类细胞溶解产物使用不是实时结果和以MaxQuant为基准

C)不相同和MaxQuant识别97%的蛋白质和90%相同的多肽。

不是从实时搜索提供了一致的结果,与离线搜索相同的数据。从数据库搜索算法在GPU上运行,搜索时间基于CPU的搜索相比可以忽略不计。

除了实时搜索的机会更大空间搜索特定的应用程序,包括包括peptidome研究,变成现实。不是以金本位为基准您搜索执行一样好或更好。

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可以节省大量的时间与实时辅助LFQ工作流ID

利用实时识别大大减少所需的时间dda-PASEFlabel-free定量(LFQ) match-between-runs (MBR)。

  • 使用TIMScore CCS增强IDs
  • 通常,把收购时间进行量化
  • 使用不是节省大量的时间

容易识别不良样品,重新获得他们运行&在开始前不定量的部分工作流程。基于我们的IM过滤XIC定量工作流是由人口普查算法(https://doi.org/10.1002/0471250953.bi1312s29)。

项目 #的样品 女士收购长度(分钟) 收购总时间(分钟) LFQ处理时间(分钟) 比例与收购
测试 2 13.33 26.66 1.25 1/21
密集的他的数据 6 40 240年 26.2 1/9
Tenzer风格HYE124 6 120年 720年 24.5 1/30
人类Ecoli飙升 18 40 720年 116.8 1/6
惠稀释 4 120年 480年 13.1 1/37
等离子体应用笔记 212年 14.4 3052.8 59.6 1/50
不是2023

看到你一直失踪

蒂姆斯即4 d蛋白质组学数据视图提供了强大的能力就像从未见过。的流动分离和聚焦上游quadrapole和TOF导致的分离等压和等压附近的物种。使用其他技术和多功能天车的充实和复杂样品的分析是很常见的,co-eluting物种等压或质量上的等压co-fragment附近。timsTOF Pro / flex消除这首先分离离子的碰撞截面。想象的能力,搜索和排序等事件之前从来没有可用的。雷竞技贴吧我们与不同的流动值移动抵消术语等压质量质量一致(MOMA)和蒂姆斯即可以梳理此类事件在复杂的运行。雷竞技贴吧蒂姆斯即允许你设置你的自由裁量权,同时覆盖特性的公差和psm观察数据库搜索。蒂姆斯即可以查看之前你永远不知道有什么。

Webinare

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视频

Meinungen

“实时的结果交付的盒子不是我们timsTOF Pro已经节约了大量时间。这让我们开发方法在实时通知信用证和仪器性能和整体效率的主要获得。”

塞巴斯蒂安Vaca博士研究科学家,蛋白质组学平台在麻省理工和哈佛(卡尔实验室),剑桥,美国

“创新的软件工具是一个需要与质谱分析解决悬而未决的生物学问题。困离子迁移功能和鲁棒性的timsTOF Pro提供了独特的自底向上的蛋白质组学功能,可以有效地用于研究许多疾病。”

教授约翰•耶茨三世欧内斯特·w·哈恩教授拉霍亚的斯克里普斯研究所,加州