Proteoforms

自下而上的鸟枪蛋白质组学非常敏感,允许研究人员深入挖掘蛋白质组。然而,重要的生物学信息,如选择性剪接或内源性蛋白质水解的影响,仍然是一个重大的挑战。

分析完整的proteoform

通过分析完整的蛋白质形态来解锁另一个维度

直接分析未消化的蛋白质形态可以克服许多限制,并构成一个非常强大的生物标志物候选发现工具。Bruker的uhr - qtof有能力处理非常复杂的完整蛋白质混合物,没有分辨率损失,精度或动态范围,使其特别适合这项任务。

实现自上而下的临床研究发现
自上而下蛋白质组学中完整蛋白质的复杂混合物对许多质谱仪来说是一个重大挑战。在质谱分析之前使用广泛的预分馏在一定程度上克服了这一点。尽管其有效性,但在比较大样本队列时,预分馏会导致再现性问题。Bruker的UHR-QTOF系统从复杂的蛋白质形态混合物中提供高度可重复和准确的信息,并且需要更少的样品预分馏,从而提高了再现性,并使其与临床研究所需的大样本队列兼容。

从蛋白质分析研究中生成无标签火山图,显示定量结果。

处理完整的蛋白质混合物

Bruker的UHR-QTOF系统将全灵敏度分辨率与真实同位素模式(TIP™)相结合,用于精确测量复杂混合物中的完整蛋白质。强大的解剖™和SNAP™算法提取准确的质量和强度信息,用于完整蛋白质的直接无标签分析。所有布鲁克QTOF仪器提供四极

CID片段谱非常适合于低到中MW的蛋白质形态的识别,而maXis II的额外ETD片段能力甚至可以从大型蛋白质形态中生成丰富的序列信息。

变形样分析溶液

Bruker的proteoform profiling解决方案包括从校准、提取和导出测量的完整蛋白质特征到通过统计分析识别调控蛋白的整个过程自动化的方法。然后,这些信息可用于创建预定的前体碎片列表,以实现相应的蛋白质形态的有效碎片,从而导致其识别。

用20分钟梯度分离的脑脊液提取物的解剖处理可恢复120多个共洗脱峰,对应于800多种不同的蛋白质形态。
在5.2分钟后对完整的蛋白质谱进行反卷积。单同位素质量使用SNAP™计算,该™考虑了实验确定的非常精确的同位素模式(真实同位素模式)。