Bruker宣布收购Integrated Proteomics Pipeline (IP2) Software

布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布最近收购了Integrated Proteomics Pipeline (IP2)搜索引擎和蛋白质组学工作流软件平台。IP2由集成蛋白质组学应用公司开发,该公司由领先的蛋白质组学研究员约翰·耶茨三世教授和博士共同创立。罗宾·帕克和徐涛。

P2通过基于gpu的可扩展搜索引擎加速了支持ccs的4d -蛋白质组学™,IP2为timsTOF®蛋白质组学系统增加了“运行&完成”实时功能

马萨诸塞州比尔利卡市,2020年9月30日——布鲁克公司(纳斯达克代码:BRKR)宣布最近收购了Integrated Proteomics Pipeline (IP2)搜索引擎和蛋白质组学工作流软件平台。IP2由集成蛋白质组学应用公司开发,该公司由领先的蛋白质组学研究员约翰·耶茨三世教授和博士共同创立。罗宾·帕克和徐涛。交易的财务细节尚未披露。

此次收购通过增加快速、可扩展和基于gpu的搜索引擎功能,进一步增强了Bruker支持CCS的4d -蛋白质组学解决方案,以实现更快的数据处理和充分利用分子碰撞截面(CCS)。雷竞技怎么下载好处包括更大的数据完整性和更高的置信度在蛋白质和PTM鉴定和定量无偏的“霰弹枪”蛋白质组学。布鲁克的新颖timsTOF质谱系统在PASEF模式下具有>120 Hz占空比,特别适合通过gpu支持的多线程并行操作进行实时搜索。

Bruker生命科学质谱执行副总裁Rohan A. Thakur博士说:“与IP2团队和Yates实验室合作,为增强Bruker的生物信息学能力,支持4D-Proteomics™提供了绝佳的机会。”“高通量蛋白质组学需要前所未有的搜索引擎性能,包括需要非常大的数据集的低错误发现率。这将有利于蛋白质组学研究和转化医学界。我们还很高兴地宣布,Bruker的生物信息学团队成立,专注于蛋白质和数据科学,总部位于加利福尼亚州圣地亚哥,由Robin Park领导,他作为IP2资产收购的一部分加入了Bruker。罗宾将继续与耶茨实验室密切合作,担任Bruker的新角色,以及其他Bruker开放蛋白质组学软件的合作伙伴和合作者。”

加州拉霍亚斯克里普斯研究所的欧内斯特·w·哈恩教授约翰·耶茨三世补充说:“我们非常高兴能与布鲁克合作,建立一个支持ccs的生物信息平台。”“创新的软件工具是用质谱技术解决尚未解决的生物学问题的必要条件。timsTOF Pro的捕获离子迁移功能和鲁棒性提供了独特的自下而上蛋白质组学功能,可以有效地用于研究许多疾病。例如,我们目前的研究重点是进一步了解与大脑疾病有关的蛋白质,如阿尔茨海默病(AD)和自闭症谱系障碍(ASD)。”

Bruker公司蛋白质组学副总裁Gary Kruppa博士表示:“timsTOF开创了快速纳米lc时代,每天每台仪器运行超过50次4D-Proteomics™,但将瓶颈推到了下游的数据分析。”“独特的IP2 GPU搜索引擎,能够在大型队列上扩展海量数据量,实现‘运行完成’蛋白质组学,在获得大型数据集后立即获得结果。此外,通过IP2,我们希望实现一种新的范式,其中timsTOF获取将搜索结果作为实时反馈,以专注于感兴趣的蛋白质,以获得更完整的定量结果。最后,IP2为我们的其他蛋白质组学软件合作伙伴提供了一个可选的网关,以加快他们获得结果的时间。”

约翰·耶茨三世教授,斯克里普斯研究所

关于布鲁克公司

布鲁克使科学家们能够取得突破性的发现,并开发提高人类生活质量的新应用。布鲁克的高性能科学仪器和高价值的分析和诊断解决方案使科学家能够在分子、细胞和微观层面探索生命和材料。雷竞技怎么下载雷竞技网页版通过与客户的密切合作,Bruker在生命科学分子研究、应用和制药应用、显微镜和纳米分析、工业应用、细胞生物学、临床前成像、临床表型组学和蛋白质组学研究以及临床微生物学方面实现创新,提高生产力和客户成功。雷竞技怎么下载如需更多资讯,请浏览:www.videcame.com

TSRI耶茨实验室简介(La Jolla, CA)

耶茨实验室的研究重点是开发和应用基于质谱的蛋白质组学技术来解决广泛的生物学问题。我们的实验室在该领域发展到目前的状态中发挥了重要作用,开创了许多具有里程碑意义的进展,形成了流行蛋白质组学实践的基础,包括鸟枪蛋白质组学(McCormack, A. L.;席尔兹博士;古德,b;杨,美国;巴恩斯,g;Drubin d;耶茨,J. R., III。分析的化学学报,1997,67,767−776),数据库搜索(SEQUEST, Eng, J. K.; McCormack, A. L.; Yates, J. R., III. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1994, 5, 976−989), and Multidimensional Protein Identification (MudPIT, Washburn, M. P.; Wolters, D.; Yates, J. R., III. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 242−247). We continue the drive to increase the scope, sensitivity and throughput of proteomics technologies and their application to biological questions. Our research encompasses the areas of bioinformatics and software development, methods development and biological applications. The integration of all the elements in the proteomics pipeline within one lab facilitates advances in all of them. The Yates lab has published more than 700 peer reviewed papers. Recent highlights include comprehensive proteomics studies revealing molecular mechanisms implicated in Cystic Fibrosis as well as identification of proteins capable of restoring function to mutated proteins in the disease, and investigations into affective disorders of the brain, including schizophrenia and depression.http://fields.scripps.edu/yates/wp/

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