超分辨率显微镜

SRX软件

测量分析帮助研究人员快速,轻松地分析收集的分子定位数据雷竞技怎么下载

SRX软件定量分析

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分析

生物成像是一门定量学科

虽然图像本身在视觉上令人印象深刻,并提供定性、描述性的信息,但生物成像更多地关注定量测量。定量测量使科学家能够测试和检查假设,并进行数据驱动的实验。

定位显微镜在一段时间内生成一组精确的分子定位数据。雷竞技怎么下载然后使用这些数据创建图像。定位数据允许对样品中的分子位置进行直接定量分析,与基于图像的技术(如STED和SIM)相比,提供了一种完全不同的分析类型。雷竞技怎么下载

SRX接口与聚类分析,测量模式,和图形。

SRX软件中可用的测量类型

SRX软件提供了许多工具,允许用户根据所获得的定位数据的统计分析来执行测量。测量包括空间分布、聚类分析、共定位、分辨率分析、活细胞分析和建模控制数据的生成。

空间分布

检测定位数据空间分布的实验是一项基本分析,也可以是进一步分析的先导。空间分布测量提供了关于细胞不同区域内定位密度的有价值的信息。比较细胞区域之间的定位分布差异或不同处理或条件下同一细胞区域的差异,可以为分子组成提供有用的见解,并为理解通路和分子功能提供有价值的推断。雷竞技怎么下载提供的分析分布的工具包括Ripley 's K,对相关和最近邻。

聚类分析

分子经常形成簇,通过空间分布分析可以很容易地识别。群集的潜在存在通常在实验前假设或假设,基于其他光学显微镜模式(如共聚焦)的发现。

存在于簇中的分子的意义可能与其结构作用、功能作用或两者都有关。在细胞条件发生变化的某些情况下,可能会形成簇。集群在不同的条件下也可能改变组成。簇的形成和组成也可能与其他簇或分子有关(见共定位)。

聚类分析提供了对样本中观察到的聚类的更详细分析。聚类分析对话框允许用户设置聚类分析的参数,如粒子类型、聚类大小和粒子数量,并具有显示功能,帮助可视化聚类形成,并具有各种测量参数,用于查看和输出到.csv或.mat文件。集群可视化也可以显示在主SRX可视化窗口中,并可用于过滤数据。

聚类分析测量包括粒子计数、聚类面积、聚类密度、聚类大小(体积)、质心位置和主成分分析。

Co-localization

共定位是聚类分析和空间分析的自然延伸,允许用户检查不同类型分子的聚类关系以及不形成聚类的分子之间的关系。

聚类分析对话框允许用户配置不同类型分子的聚类测量。输出显示共定位测量的图形显示,表格数据,以及在SRX可视化窗口中显示图像结果。共本地化数据支持。csv和。dat格式输出。

共定位测量包括Mander重叠系数、强度相关商、对相关、最近邻、联合直方图和Storm-RLA聚类分析。

Live-Cell分析

活细胞实验通常需要量化粒子或集群(物体)随时间的位置变化。活细胞分析跟踪粒子位移并显示它们随时间的运动。

然后可以从这些数据生成距离、速度和角度分布直方图,以辅助分析。图形显示和运动图形可以输出为图像,表格数据可以输出为.csv和.mat文件。