的标准高速,高灵敏度,4 d-multiomics

timsTOF专业2

timsTOF Pro 2,由最新的并行串行碎片(PASEF积累®)技术,为4 d-multiomics应用铺平了道路。证明了鲁棒性、高灵敏度和快速MS / MS收购,timsTOF Pro 2是4 d-proteomics的首选平台,4 d-metabolomics和4 d-lipidomics。

4 d-omics的时代

打开第四维度的价值

Punti salienti

timsTOF专业2

4 d-omics飞跃

速度
PASEF®技术达到> 120 Hz测序速度而不影响分辨率。
深度
额外的离子迁移维度增加数据完整性。
鲁棒性
独特的仪器设计使强劲性能和常规手术在成千上万的样品不需要清洗。

Caratteristiche

的新标准高速、高灵敏度4 d-multiomics

液相色谱与质谱(LC)耦合(MS)已经成为各种组学领域的金标准。然而,蛋白质组的报道或代谢物在复杂生物样品仍然具有挑战性由于有限的速度,当前质谱仪的灵敏度和分辨率。

添加困离子迁移谱法(蒂姆)方程解锁并行串行碎片(PASEF积累®)收购方法提供极高的MS / MS速度和灵敏度,要求最小的样本数量。

Dual-TIMS和CCS-enabled分析

蒂姆斯首先是在气相分离技术。这解决了样本复杂性通过额外维度的分离除了高效液相色谱(HPLC)和质谱分析,增加对复合特征峰容量和信心。

同样重要的是,蒂姆斯设备也积累和集中离子的给定m / z和流动性,使一个独特的增加灵敏度和速度。

近100%的占空比可以实现dual-TIMS技术促进积累在前面部分,而离子在后面部分发布的顺序取决于他们的机动性。这个过程的并行串行碎片(PASEF积累®)使碰撞截面(CCS)分析。


CCS-enabled分析开辟了许多进一步分析的可能性,从更大的确定性的化合物鉴定信心库匹配和较低的错误发现率(罗斯福)的大型数据集。

PASEF®

timsTOF Pro 2带有创新dual-TIMS分析仪提供离子能力高出三倍。简化的离子光学最大化离子转移和4 d-multiomics敏感性设立了新的标准。PASEF®是一个重新设计的MS / MS组学应用的技术,以满足速度要求。离子分离使用困离子迁移谱法,筛选了(~ 100 ms)和检测四极飞行时间(QTOF),生成蒂姆斯女士热图。PASEF®然后使用相同的商旅分离连续碎片离子。四极隔离一定离子物种在其洗脱MS / MS和立即转移到下一个先驱。父母和碎片光谱通过流动值是一致的。timsTOF Pro 2可以实现PASEF测序速度> 120 Hz®模式。此外,低丰富的MS / MS谱质量分析物可以通过选择丰富他们好几次了。

dia-PASEF®增加信心以你的身份

-PASEF Data-independent收购(dia)®比传统更敏感和选择性DIA方法同样适用于PASEF吗®原理把DIA的优点与内在离子PASEF效率®。在整个液体色谱-光谱法(质)/ dia-PASEF女士®运行时,创建一个完美的数据立方体的包含m / z,离子迁移率(CCS),保留时间和强度。蒂姆斯分离选择性增加,不包括单独控告分裂的前兆和清理的样本集中的信号噪声。利用相关的分子量和CCS编码信息dual-TIMS漏斗,dia-P雷竞技怎么下载ASEF®使高度自信的识别。

肽和蛋白质序列覆盖率最大化

的不锈钢多层环离子dia-PASEF指南(SRIG)配置和优化标准®方法timsTOF Pro 2提供了一个前所未有的蛋白质组的深度报道枪蛋白质组学。近9000个蛋白质组确认从200 ng K562溶解产物在35分钟内梯度(每天~ 30样品)使用PepSep 25厘米列与nanoElute timsTOF箴2和TIMScore™的光谱库。

timsTOF Pro 2提供了深入的蛋白质组覆盖日常细胞株蛋白质组之间的直接量化实验数据库搜索和匹配运行而不需要一个光谱库。不同的数据库搜索策略导致了非常类似的结果。不是™,使实时蛋白质识别和MaxQuant导致类似身份号码在蛋白质和肽水平。

K562消化,35分钟梯度(≈每天30个样本)dia-PASEF®K562摘要的分析。数据处理是使用不执行与蒂姆斯DIA-NN™。

Applicazioni

高通量蛋白质组学针对前所未有的敏感性

prm-PASEF®得益于蒂姆斯作为一个4th的时间维度的无与伦比的选择性分离,离子的商旅筒增加灵敏度,和高速度由PASEF促成的®增加前体的数量目标。在一个单一的收购数百前驱可以有针对性的独特的选择性和高灵敏度的前提下timsTOF Pro 2仪器。

结合灵敏度、速度和选择性,prm-PASEF®收购方法交付高重现性和精确定量的目标或应用色谱梯度较短(例如< 5分钟)。

目标protoemics分析结直肠癌等离子体研究。1565前体(重/轻)从565年蛋白质被目标prm-PASEF®实验中,使用Biognosys PQ500工具包。

“我们已经构建prm-PASEF与力量密切合作®从地面行动。在我们的合作,我们一直印象深刻的世界级的结合速度、灵敏度、prm-PASEF提供的和鲁棒性®。我们兴奋地把这个性能更上一层楼timsTOF Pro 2。”

杰罗德·a,博士,副教授,病理学系布莱根妇女医院和哈佛医学院,美国波士顿丹娜-法伯癌症研究所

与4 d-metabolomics扩大视野

PASEF®提高MS / MS谱图书馆为了更好的匹配结果。

一道代谢组学受益于高MS / MS复合注释的覆盖率作为一个关键组成部分。我们优化4 d-metabolomics方法提供定量分析数据女士和MS / MS碎片光谱在同一个样本分析,实现大部分功能覆盖率即使在低浓度分析物。PASEF®前提供移动选择光谱分裂导致清洁和明确的片段。

PASEF®能够移动选择单独和每个化合物碎片,导致清洁碎片光谱。删除矩阵派生MS / MS片段提供了更好的图书馆匹配MetaboScape普罗地芬®因此更高的信心的结果。

4 d-lipidomics更高的信心

类似于蛋白质组样品,脂质提取样品高复杂结构的多样性造成的脂质。高质量的MS / MS谱积分获得自信的脂质注释。PASEF®另外解锁CCS-enabled工作流可以用来促进脂类注释的信心。

Lipidomics数据获得timsTOF Pro 2与MetaboScape可以很容易地分析®,这档节目的特点就是一个library-free注释工具,利用分段规则和出版小说CCS预测工具。充分利用所有的4个维度。

PASEF®可以通过使用片段> 10 x前兆流动分离。该污染物去除重叠,并解决了等压以及异构脂质。结果MS / MS谱显示独特的脂质类导致每个注释片段与增加信心。

移动抵消大规模对齐(MOMA)数据等压脂质(A)的热图显示两个等压的流动分离磷脂co-eluting从LC逆转阶段。(B)清洁PASEF®MS / MS谱后流动分离。从1950年NIST SRM (C)独特的脂质注释(ESI + ve模式)对不同梯度运行时间。

“PASEF®已经开箱即用的增加脂质前体覆盖有一个关联的一份光谱到70%。这一光谱对脂类的正确识别至关重要。之上,使用CCS信心增加了额外的注释通过添加一个额外的信息层RT、女士和女士/小姐”

联席主管迈克尔博士有意的代谢组学和蛋白质组学的核心,Neuherberg、德国亥姆霍兹慕尼黑中心的

Ultrahigh-throughput自信的筛选和量化复杂的矩阵

2的特殊速度timsTOF Pro系统允许完全未知的筛选与GC-APCI或UHPLC VIP-HESI数据采集。结合TASQ®软件,力量提供了一个完整的解决方案从数据采集到自动化的数据分析。

应用mobility-filtering提取离子色谱图增加敏感性在复杂矩阵通过消除干扰。这明显可以看到在跟踪Thiacloprid在洋葱1 ng / mL的浓度。较低的痕迹一直在逐渐缩小过滤流动范围,允许一个完美匹配TargetScreener数据库,显示的绿色MRSQC得分。


极高的鲁棒性

最小的清洁要求
许多女士仪器用于组学应用程序需要每月清洁一天24小时运行时在大样本人群。性能退化

明显的甚至在更短的时间。timsTOF Pro的优越的鲁棒性2意味着仪器可以24/7运行许多周没有明显损失的敏感性或其他性能指标。

“自从我们开始使用timsTOF Pro 26个月前2019年2月,我们已经运行超过25000 LCMS样本,其中5000例已经non-depleted等离子消化。到目前为止我们已经几乎为零停机时间。”

罗马菲舍尔博士在临床Proteomcs副教授,目标发现研究所,英国牛津大学

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