代谢组学方法

T-ReX®LC-QTOF溶液

因为每一步都很重要……

简化的霸王龙®LC-QTOF代谢组学解决方案

几个关键步骤对于确定与动态代谢过程相关的化合物是重要的;包括样本制备、数据采集和数据评价。只有在控制所有这些工作流程步骤的情况下,才能在生物学背景下获得有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授和他的团队合作,开发了T-ReX®LC-QTOF解决方案。

“霸王龙……®LC-QTOF解决方案“包括为研究人员在非靶向代谢组学方面提供领先优势的一切

关键的第一步一道代谢组学是一种可重复的样品制备。因此,该代谢组学解决方案提供了用于制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(SOPs)。

高质量LC-MS/MS数据的获取遵循T-ReX在非靶向代谢组学工作流程中的样品制备®LC-QTOF解决方案,无需LC-MS/MS参数优化。对大样本队列的分析需要较高的保留时间稳定性洗提UHPLC与专门的霸王龙相结合®洗脱代谢组学试剂盒:RP提供。反相LC色谱柱套件使保留时间匹配的值布鲁克HMDB代谢物库2.0.的影响二世用于MS/MS数据采集使用优化的参数,其稳健的性能是高质量数据采集的基础,能够对复杂样品进行广泛的分析研究。

在数据采集之后MetaboScape®软件提供了简化的数据评估,能够自动和自信地识别相关的已知化合物:

  • 独特的霸王龙®三维特征提取技术是后续代谢产物鉴定和统计数据评价的关键。通过自动进行无参数保留时间比对和区域完全提取,提取所有相关信息,使代谢物鉴定更加自信,同时降低统计分析中的假阴性率。
  • 布鲁克HMDB代谢物库2.0作为代谢组学解决方案的一部分,提供>800代谢物的质谱和>600相关代谢物的保留时间信息。库是自信识别相关标记的前提。
  • 注释质量(AQ)评分提供了对每个注释参数的信心的快速概述。
  • 通路映射功能可以将已识别的化合物设置为生物学背景。

“我们很高兴能与Bruker合作制作综合产品霸王龙®LC-QTOF解决方案.完整的开箱即用的解决方案为相关已知内源性代谢物的高可信度鉴定提供了基础,并能够使用通路映射将这些代谢物置于生物学环境中。这种解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学方面提供领先优势。”

李亮博士,加拿大阿尔伯塔大学化学教授

mrm aXelerate

磁共振质谱(MRMS)表型

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,可以对复杂混合物进行深度代谢分析,以发现表型背景下的代谢组学。通常,不同的LC方法和数据采集在正离子和负离子模式相结合,这是有成本的;分析每个样品所需的时间。
磁共振质谱(MRMS) eXtreme Resolution通过省略耗时的色谱,加速了表型组学和发现代谢组学研究中的样本吞吐量。基于流动注射分析(FIA)或MALDI的工作流程提供了LC-MS分析不易检测到的化合物,并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求,就像表型学研究中通常遇到的那样,UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,MRMS aXelerate是一种无需lc的MRMS工作流程解决方案,可检测并生成每个样品> 1000个中高水平代谢物的分子式,并揭示许多LC-MS中未见的额外代谢物,包括极性化合物。雷竞技怎么下载通过FIA或MALDI进行MRMS分析可为复杂样本(如尿液和血浆提取物)的表型分析提供高样本通量。强大的数据提取由T-ReX®二维的MetaboScape®提供自动注释的可信度。这是通过<0.2 ppm的质量精度和超过> 100万的质量分辨率实现的,从而提高了同位素精细结构的保真度。

在最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流如何通过与人类代谢组数据库的匹配增加2.6倍和IFS模式的增加来帮助解决阐明“黑暗代谢物质”的问题:发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS

“MRMS eXtreme分辨率使我们能够解决下一代代谢分型问题,即同时快速描述数百种已知的和数千种与动态生物/化学过程相关的新代谢物。MRMS与MetaboScape的结合也将使其他研究人员能够在这个新的、令人兴奋的研究领域探索“黑暗的代谢组”。

Philippe Schmitt-Kopplin教授,分析生物地球化学,Helmholtz中心München,德国

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仅供研究使用。不用于临床诊断程序。