不是2023

PaSER整合的实时搜库和智能采集功能打破了数据分析的瓶颈

通用性

• PaSER支持所有timsTOF Pro和fleX平台。

4d -蛋白质组学

• 尽管CCS信息的加入使得数据量大增,但不是的实时搜库功能则能应对大数据带来的挑战,即使包括像磷酸化在内的多种翻译后修饰同时检索,实时搜库功能也能轻松应对。

Gpu支持的海量数据并行计算

• PaSER基于GPU计算，可提供数以千计的CUDA核心并行数据处理。

PaSER数据查看

• 从高水平实验信息到目标特定碎片离子谱图，PaSER实现在集成视图中查看数据的全部细节信息。

智能化

• 不是可以智能化决定样本列队分析进程,每个样本采集结束时,通过将实验结果与预设的蛋白质或肽段鉴定数量标准比对,来决定样品队列继续与否,该功能可核验方法的适用性,节省稀有样本,昂贵耗材和机时。

1）安心上机稀有样本

2）高效利用珍贵机时

3）避免浪费高成本样本

4)无需再耗时等待qc结果来确定系统适用性

5）方法开发过程中无需等待搜库结果

CCS维TIMScore引入度来为4 d -蛋白质组学提供更高的PSM (peptide-spectrum匹配),肽段和蛋白质鉴定数量。

不是搜索引擎将肽段的CCS测量值与预测值进行比较,并计算出每张谱图对应的前五个候选肽段的TIMScore值。TIMScore的优势体现在肽段验证和罗斯福(错误发现率)评估中,在不支持CCS值的算法中,只能利用两个维度数据来评估罗斯福,目标肽段和候选肽段基于1%误差进行的判定(面板)。而支持CCS值的TIMScore算法中,候选肽段可在三个维度上矢量化,从而能够通过可显著区分的等值平面来进行1%误差卡控,使用等值平面判定可提高结果的准确度和精确度,有助于验证以前在传统二维数据中评分不佳的PSM。

不是2023整合了来自Lilley等人实验室的DIA-NN定制版软件,成为了一个能够满足dia-PaSEF数据处理的平台。Tims diana - nn可以为大队列实验提供可靠的，稳健的和精确定量支持。不是对dia-PaSEF工作流采用相同的机制,将实时女士数据和DIA窗口从采集服务器传输到不是服务器,在采集结束时自动触发谱图库比对操作并将结果进行记录。TIMScore支持的银两搜库结果可轻松用于谱图库构建,或可将其他搜库软件生成的谱图库进行导入。项目结束时,用户可触发项目内不同样品间MBR(匹配)来查看详细定量结果,这为用户提供了一个dda-PASEF和dia-PASEF两种数据集成的分析环境。

超高搜索速度获取无损搜库结果。

一)人源细胞裂解样品多次重复银两采集结果在pas和MaxQuant上的鉴定结果比较

B)人源细胞裂解样品多次重复银两采集结果在pas和MaxQuant上的鉴定结果比较

C) PaSER和MaxQuant搜库结果中蛋白一致性达97%，肽段一致性达90%

PaSER对同一数据的实时搜库获取结果与离线模式搜索结果一致。由于PaSER是基于GPU的搜库算法，因此相比于CPU其运行时间可忽略不计。

除此之外，per也为需要更大检索范围的特定应用(如PTM)提供可行性。PaSER建立的搜库基准与DDA搜库金标准水平相当，甚至更好。

利用实时数据库检索的优势,可以大大缩短dda-PASEF数据采用MBR(匹配)得到非标记定量结果的时间。

• TIMScore引入CCS维度提升蛋白鉴定量
• 一般来说，数据定量时间仅需采集时间的 1/20
• PaSER可大大节约数据分析时间

凭借不是运行即结束(运行&)功能,在进行定量流程前,就能够识别数据质量差的样本并重新进行数据采集。PaSER基于淌度(IM)过滤的提取离子流图(XIC)定量流程是根据人口普查算法(https://doi.org/10.1002/0471250953.bi1312s29）开发的。

蒂姆斯Vis提供了强大的四维蛋白质组学数据查看能力,有可能看到之前未能观察到的数据,在四极杆和TOF之前的离子淌度的分离和聚焦可以实现对同重素或者质荷比接近的离子进行分离。在分析富集的天车样本或复杂样本时,如果采用其它技术,共洗脱的同重素或质荷比接近的离子会产共同碎裂现象,采用timsTOF Pro / fleX则可以通过CCS值的不同进行分离、相对之前的技术,无论是在可视化方面还是库检索方面,这都是一种新的能力。我们为质量相同离子淌度值不同的离子定义一个新的值现代艺术博物馆(移动抵消质量一致),蒂姆斯力可从复杂的数据中提取这个信息,并且在数据库检索结束后,可以通过设置容差(公差)自由显示特征(特性)和psm的叠合图,让您产生之前从未有过的新发现。