timsTOF HT
高通量4 d-proteomics™
高动态范围和定量精度
Punti salienti
扩展高通量4D-Proteomics™的功能
Caratteristiche
基于TIMS的离子迁移率分离和启用ccs的分析
新的timsTOF HT质谱仪配备了第四代高容量TIMS-XR分析仪和先进的数字化技术(ADT)。它为高通量蛋白质组学实验提供了无与伦比的分析深度和定量的更高动态范围。timsTOF HT完全启用了ccs，并支持所有PASEF®包括PASEF在内的收购模式®, dia-PASEF®和prm-PASEF®实现4D-Proteomics™的灵活性。简单地不妥协的蛋白质组深度的规模。
Applicazioni
使用dia-PASEF进行快速组织蛋白质组分析®
快速心脏组织蛋白质组学。用短液相色谱梯度和dia-PASEF分析了不同量的小鼠心脏蛋白质组消化酶的三次重复®。在最高的样品负载下，我们鉴定了总共4700个蛋白质组，其相对丰度超过5个数量级。原始数据用无文库模式的DIA-NN处理，蛋白质拷贝数用“蛋白质组学标尺”方法估计。
“组织分析是临床蛋白质组学的关键领域，但由于组织切片和活检包含大量异质性细胞群，因此极具挑战性。的dia-PASEF®timsTOF HT仪器上的采集模式可以在很大的动态范围内定量蛋白质，即使是在心脏组织等众所周知的困难样品中，也不会牺牲吞吐量或灵敏度。”
具有dia-PASEF的细胞系前所未有的深度®， TIMS, DIA-NN和passer
对于更高的蛋白质组深度，增加的蛋白质消化负荷可以提高鉴定。采用nanoElute系统，在Aurora柱(25cm, 75 μm ID, IonOpticks)上，以250 nL/min的速度分离60 min，分析了人细胞系K562 (Promega)的色氨酸消化。timsTOF在非传输式操作®模式使用100 ms TIMS分离。使用来自uniprot(人工审核)的预测文库，使用TIMS DIA-NN对数据进行处理。
靶向血浆蛋白质组学:以30分钟的梯度定量超过550种蛋白质
我们结合使用PQ500 (Biognosys)稳定同位素标准(SIS)和dia-PASEF®基于的方法，在timsTOF上使用30分钟梯度。578个蛋白(对应804个多肽)可准确定量，数据完整性为bb0 99%。这种方法结合了传统SMS/MRM方法的选择性和灵敏度，以及易于使用的采集设置，也允许在后验定义新的目标。
纳米色谱柱在更高的样品负载下获得最佳结果
A) TIMS-XR允许在样品负载超过200ng时增加离子容量。可重复鉴定约6900个蛋白质组和86000多个独特的肽。
B)使用PaSER实时搜索引擎识别的数量TIMScore™为dda-PASEF高达1600 ng K562胰蛋白酶消化。误差条表示5个重复的标准差，平均值显示在直方图上方。
使用PepSep 25系列色谱柱(150 μm ID, 1.5 μm粒度)，K562色氨酸消化(Promega)样品负载高达1600 ng时，平均峰宽小于5秒。41分钟的梯度时间足以进行有效的肽分离，即使在高肽负荷下，也可以在梯度上进行均匀的肽洗脱。
Testimonianze
“我们正在与布鲁克合作，将DIA-NN定制为dia-PASEF的简化处理工具®以CCS为重点的数据是有益的。它在很短的时间内简化并加速了对数千种蛋白质的识别和定量。我们很高兴通过与布鲁克的密切合作，供应商集成版的TIMS DIA-NN现在成为PaSER生物信息学平台的一部分。”
物质不是消费
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文献室质谱分析
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仅供研究使用。不用于临床诊断程序。