timsTOF HT
高通量4d -蛋白质组学
动态范围广，定量准确性高
亮点
扩展高通量4d -蛋白质组学的功能
特点
捕集型离子淌度分离，支持CCS值分析
全新的timsTOF HT质谱仪整合了第四代超高离子容量的TIMS-XR分析器和更先进的数字转换技术。新的设计为无与伦比的蛋白质组学分析深度和高通量定量分析提供了更宽的动态范围。timsTOF HT提供全面的 CCS 值辅助分析，并支持所有基于平行累积连续碎裂技术（ PASEF®)的数据采集模式，pasef®, dia-PASEF®和prm-PASEF®使得4d -蛋白质组学分析拥有更高的灵活性，轻松实现蛋白质组的全覆盖。
应用
dia-PASEF®实现更快速的组织样本蛋白质组学分析
针对心脏组织样本的快速蛋白质组学分析示例。通过dia-PASEF®和 30 分钟短梯度色谱分离，对不同样本量的小鼠心脏组织蛋白酶解液进行三次重复分析。在进样量为800ng时，能鉴定到4700个蛋白，蛋白相对丰度跨越5个数量级。原始数据使用DIA-NN的非建库模式进行数据检索,蛋白拷贝数通过蛋白质组学统治者的方法进行估算。
“组织分析是临床蛋白质组学至关重要的部分,然而由于组织切片和活检样本包含及其广泛的异质细胞群体,使其分析和研究极具挑战性。timsTOF HT质谱仪采用的dia-PASEF®数据采集模式在不牺牲通量和灵敏度的前提下,对心脏组织这类众所周知的高难度样本进行定量蛋白质组学分析时,依然能够达到非常宽的动态范围。”
dia-PASEF®和TIMS DIA-NN, PaSER的强大组合使细胞系蛋白质组获得前所未有的深度覆盖
加大蛋白酶解液的进样量能够提高鉴定量，获得更高的蛋白覆盖深度。如图为使用Aurora-25厘米色谱柱,在250 nl /分钟的流速下,通过60分钟色谱梯度洗脱,结合timsTOF HT质谱仪的dia-PASEF®(100毫秒淌度分离)数据采集模式对人类细胞系k562的胰酶消化液进行质谱分析结果。采集后的数据通过TIMS DIA-NN搜库分析，数据库为uniprot人源已注释蛋白。
靶向血浆蛋白质组学：30 分钟梯度定量超过 550 个蛋白
timsTOF HT的dia-PASEF®采集方式与Biognosys公司的PQ500稳定同位素标肽技术结合,对血浆蛋白质组进行靶向分析。在 30 分钟色谱梯度下，可以实现对 578 个蛋白（ 对应 804 条多肽 ）的准确定量，数据完整性超过 99%。该方法通过一个简单快捷的采集设置将传统SMS / MRM技术的选择性和灵敏度结合起来,并能够根据经验后续再进行新靶标的选择。
适用于更高进样量的纳升流速液相色谱柱
A)全新的TIMS-XR分析器拥有更高的离子容量可支持高于200ng的上样量。可稳定重现鉴定 ~ 6900 个蛋白质，超过 86000 条特异性肽段。
B)不同进样量的K562酶解液采用dda-PASEF模式采集,使用不实时搜索引擎和TIMScore™算法得到的鉴定结果。误差值为五次重复的标准偏差。
PepSep 25厘米系列色谱柱(内径150,粒径1.5 um),对于上样量达到1600 ng的K562酶解肽段进行分析时,依然能够保持平均峰宽小于5秒。41 分钟的色谱梯度足够支持有效的肽段分离，即便是更高的上样量，也能够获得同源性多肽的分离。
用户反馈
我们与布鲁克持续合作，致力于优化DIA-NN，使其在处理有淌度值辅助的dia-PASEF®数据时能更快捷简便，这是一件非常有意义的事。它将极短梯度下洗脱的数千蛋白的鉴定与定量过程简化并提速。我们感到很欣慰,通过与布鲁克的密切合作,整合后的DIA-NN,命名为蒂姆斯DIA-NN、已成为不是软件平台的一部分。”
更多信息
文献室质谱
支持
联系我们
仅供研究使用。不适用于临床诊断程序。